私なら、次の手順で調べます。
まず正常な場合の Starting CSMA-CA 表示までの呼び出し履歴をPHYを含めて確認する。
デバッガでブレークポイントを設定するのが楽かもしれません。
止まったら、PHYとMACの状態をメモしておく。

次に、PHYの動作止める という方法が正しいのか確認する。
どのような方法(処理)でPHYの動作を止めているのか不明ですが、
再開の方法(処理)が正しくなくて、永遠に止まったままになっているのかもしれません。

いずれにせよ、組み込んだ箇所を丁寧にデバッガで止めながらチェックするか、
専用のデバッグ用ログを組み込んで確認するしかないと思います。