シナリオは確認していませんが、おそらくPHYの802.11a/gと802.11bがQualNetの同一チャネルで混在していることによる問題では無いでしょうか。
異なるPHYモデルをQualNetの同一チャネルで混在させることは出来なかったはずなので、チャネルを分ける必要があると思います。

Scenario PropertiesのChannel Propertiesで複数チャネルを用意し、PHYの設定で802.11a/gと802.11bで異なるチャネルをListening/Listenable Channel Maskに設定すれば動作するのではないでしょうか。

802.11a/gと802.11bが同一シナリオで完全に独立して動作するような評価であればコレで対応できる気がします。

しかし、そもそも802.11a/g, 802.11bの干渉を評価したいのであれば、大規模な改修が必要になるのではないかと思います。