はい、QualNetのシナリオは全てテキスト形式のファイルですから
適当なテキストエディタで編集することで自分の望むシナリオの
モデリングが可能です。具体的な記述形式についてはdocumentation
ディレクトリにあるpdfに記述されているので読んでみて下さい。

でも、最初はscenario designerを使って作成したシナリオの内容を
編集することをお勧めします。
初心者が全く白紙の状態からシナリオを作るのは相当難しいですよ。
私もQualNetを数年使ってますが、いきなりシナリオ作るのはできないな。