一般的に、改造した結果が思わしくない(期待した動作をしない)場合は
改造内容そのものが自分の意図した改造ではないからだと思います。
思わぬ副作用を引き起こした改造になっているのか、改造した内容が
機能的に不十分だと思われます。

まず行うべきは、全てのAODVパケットを追いかけ、AODVのアルゴリズムに
したがって、各NodeのAODVがどのような処理を行っているかをきちんと
把握することでしょう。そして改造したことによりAODVの処理がどのように
変化したのかを確認することです。

何をどのように改造したのかは、改造した本人にしかわかりません。
AODVの動きをどこまで確認したのかも、本人しかわかりません。
実際に何が起きているか、確認できるのは本人だけです。

原因がわからなければ、わかるための調査を行うしかありません。

近道はありません、AODVのデバッグを地道に行うしかないと思います。