QualNetの動作としては、いつも一定の位置で正しいです。
シミュレーションなので、何度実行しても同じ動きになります。
乱数でも同様で、条件(シナリオ)が同じであれば必ず同じ乱数列になります。
QualNet内部ではNodeの移動だけでなく、
いろんな場面で乱数が使われていて、
それを再現させるための工夫が施されています。

UsersGuide.pdf の 3.2.3 Configuring Parameters に記述がある
SEED パラメタの説明を読んでみて下さい。

SEEDは乱数列のパターンを変化させるものです。