関連情報ですが、Windows 64bit環境の場合に、
Javaの64bit版(たとえば、jdk-1_5_0_22-windows-amd64.exe)を
インストールしてもQualNet GUI起動時にJavaを認識してくれません。

Javaの32bit版(たとえば、jdk-1_5_0_22-windows-i586-p.exe)を
インストールすれば問題なくQualNet GUIが使えます。

なおJavaのバージョン6ですが、ダメもとで現在の最新版
(jdk-6u20-windows-i586.exeやjdk-6u20-windows-x64.exe)を
32bit環境と64bit環境にインストールしてみましたが、
症状は同じでした。
やはりバージョン6はダメなようです。

ちなみに確認したWindowsは、
Windows 7 Home Premium 64bit [Version 6.1.7600]
と
Windows 7 Home Premium 32bit [Version 6.1.7600]
です。