hiroさん　お返事ありがとうございます。


話がやや逸れて申し訳ないのですが、今恐らくhiroさんのお手許にあると思われるシナリオで、似たような
現象を確認することができました。

scenarios\default\default.config

QualNetをインストールした際に一緒にインストールされるサンプル
ファイルのようなものだと思いますが、これを「Run Scenario」するのと
「Import Scenario」するのでOutput Windowsで表示される結果が異なっています。
（具体的には、Events in partitionの値が大きく違う。アニメーションを見た感じでも、違う通信が行われているように見えます。なお、Events in Partition の値は、Run scenarioと CUIによるqualnet default.config で一致しました。）


恐らく自分のところで起こっている問題と関連があるのではないかと思う
のですが、いかがでしょうか。