ネットワークについてもまだ初心者なもので仕組みや言葉を勘違いしてるかもしれないので設定から書きます。

まず中継ノードではないノードはCBRアプリケーションを用いてつなげています。
つぎにどちらかのノードからパケットを転送する際、中継ノードが転送するのですがこの転送がどこのレイヤ、プログラム上では関数、で行われているのかがわかりません。

バッファではなくキューでした。パケットを受け取った際に一時的に保管されて転送されていると思うのですが・・・ちなみにFIFOを使っています。

もしかしたら転送の仕組み自体を勘違いしてるかもしれません。
送信ノードから発生したUDPパケットは中継ノードが受けとりパケットはIPのヘッダをつけたまま転送されていると思っています。