kshimaさまへ

貴重なご意見ありがとうございます．

>ノードをランダム配置した場合、ノード間距離によっては、node1-node2へのアプリケーションを設定しても、
>トラフィックが届かない可能性があります。という意味だと思います。
ここに関してはなんとなく分かる気がします．
ランダム配置をしたときは，ノード間距離と通信可能範囲に気をつけろという意味ですよね？
うまく設定しないと通信が不可能なペアになってしまうということだと解釈しました．

>ノードのランダム配置についてはここが参考になるかもしれません。
早速拝見させていただきました．
詳しく書かれていたり，ツールがあったりと，簡単に試せるようなので，早速やってみます．

>コマンドラインで実行するなら、引数に結果ファイル名を指定できます。
>UsersGuideの7.1.1あたりに書いてあります。
コマンドラインはこれから早急に勉強してみます．
マニュアルに乗っているものはQualnet専用のもののようなので，もっと基本的なとこから学んでみます．

>私はwindowsでcygwinを使ってスクリプトを回してます。
>一度スクリプトを書けるようになってしまえば、1000回の試行→グラフ化まで簡単にできるようになって、考察にタップリ時間が使えますよ〜。
スクリプトというのがまだ調べたりないですが，非常に魅力的なものだというのは分かりました．
Windowsでも出来る方法を示していただき，ありがとうございます．
早速cygwinについても調べてみます．

本当にありがとうございました．