User's Guideを見る限りだと、トランスポート層のみとか、ルーティング層のみといった、レイヤ毎のアニメーションはできないみたいですね。

Table 3-1. Type of Animation Associate with Animation Filtersによると、以下のようになっています。
Network: packet reception (green arrows)
Transport: none
Routing: none

IDEにAnimation Filtersという項目があったので、トランスポートのみ、ルーティングのみといったアニメーションができると勘違いしていました。
良く確認せずに書き込んでしまい申し訳ありませんでした。