これ、自分も最初は全く分かりませんでした。。
結論から言うと、統計値を記録している部分や、最終的に出力（*.statファイル）する部分のソースを見るのが早いかも、という感じです。

統計値の記録部分は、各種イベント時（例えばパケット送信時、受信時など）に各所で行われていますが、最後の出力処理はFinalize関数でシミュレーション終了時に行われています。



なお縦軸が小数になっている場合も注意が必要で、これは恐らくGUIの仕様ではないかと思ってます。

例:1000000 → 1.0 * e6など

ご参考になれば幸いです。