始めまして。アプリケーションモデルを改造したい、という事ですよね。
詳しく弄った事はないのですが、基本的にClientからのデータ送信はQualNetのメッセージ（タイマや、レイヤを跨った処理、パケットもこの一種）イベントで呼び出されているので、この辺りが参考になるかもしれません。

メッセージの扱いは、QualNetを少し深く弄ろうとすると出会うものです（多分）。
Programmers Guideの3.3 Discrete-event Simulation in QualNetあたりの記述が参考になるかと思います。

＃　もっと簡単なやり方もあるかも？
＃　MESSAGE_Allocして必要なInfoだけをくっ付けて、MESSAGE_Sendする代わりに
＃　関数AppLayerMCbrClientを直接呼び出すとか…
＃　やった事ないので、だいぶ微妙ですが。。