IDEから設定する方法があれば一番よいのですが、見つからないので
ご存知かもしれませんが代わりの方法を示します。

200ノードのうちノードIDが101から200までのノードに対して、
デフォルトを変更して100ノードに同じ設定を行う場合、
configファイルに以下のように追記することで設定できます。

・その時関連するパラメータは全て追記してください。
・次回IDEを起動した時には追記した内容は削除されているので
　注意してください。

例(PHY-MODELを802.11aに変更する場合)：
[ 101 thru 200 ] PHY-MODEL PHY802.11a
[ 101 thru 200 ] PHY802.11-AUTO-RATE-FALLBACK NO
[ 101 thru 200 ] PHY802.11-DATA-RATE 6000000
[ 101 thru 200 ] PHY802.11a-TX-POWER--6MBPS 20.0
[ 101 thru 200 ] PHY802.11a-TX-POWER--9MBPS 20.0
[ 101 thru 200 ] PHY802.11a-TX-POWER-12MBPS 19.0
[ 101 thru 200 ] PHY802.11a-TX-POWER-18MBPS 19.0
[ 101 thru 200 ] PHY802.11a-TX-POWER-24MBPS 18.0
[ 101 thru 200 ] PHY802.11a-TX-POWER-36MBPS 18.0
[ 101 thru 200 ] PHY802.11a-TX-POWER-48MBPS 16.0
[ 101 thru 200 ] PHY802.11a-TX-POWER-54MBPS 16.0
[ 101 thru 200 ] PHY802.11a-RX-SENSITIVITY--6MBPS -85.0
[ 101 thru 200 ] PHY802.11a-RX-SENSITIVITY--9MBPS -85.0
[ 101 thru 200 ] PHY802.11a-RX-SENSITIVITY-12MBPS -83.0
[ 101 thru 200 ] PHY802.11a-RX-SENSITIVITY-18MBPS -83.0
[ 101 thru 200 ] PHY802.11a-RX-SENSITIVITY-24MBPS -78.0
[ 101 thru 200 ] PHY802.11a-RX-SENSITIVITY-36MBPS -78.0
[ 101 thru 200 ] PHY802.11a-RX-SENSITIVITY-48MBPS -69.0
[ 101 thru 200 ] PHY802.11a-RX-SENSITIVITY-54MBPS -69.0
[ 101 thru 200 ] PHY802.11-ESTIMATED-DIRECTIONAL-ANTENNA-GAIN 15.0
[ 101 thru 200 ] PHY-RX-MODEL PHY802.11a

・こうした場合に便利な機能を紹介します。
追記したい内容を別ファイルに保存しておき、configファイルに
　INCLUDE <ファイル名>
と一行追記すれば、別ファイルの内容をconfigファイルに記述する
のと同じことができます。
パラメータが多い場合や何度も実行する場合に追記する手間が少し
省けると思います。

お望みの回答ではないかもしれませんが、ご参考にしていただければ
幸いです。
別の方法をご存知の方がいらっしゃいましたら紹介していただければ
と思います。