こんにちは
全てを見たわけではないので気付いた点だけ。
見当違いだったらすみません。

設定されているFTP/GENERICのアイテムサイズは1GBと大きなもので、
300秒のシミュレーション時間でセッションが完了していないのではないでしょうか。
FTP/GENERICのスループットは、セッションの開始から終了までの時間で計算しています。
見られているスループットは受信側の[Gen/FTP Server Throughput (bit/s)]と思いますが、
逆に送信側の[Gen/FTP Client Throughput (bit/s)]のほうを見てみると、どの送信ノードにも値が記録されていません。
(つまり送信側ではセッションが完了する前にシミュレーションが終了している)
また、Server Throughput で値が出力されているものは、
たまたま途中でセッションが切れているのではないでしょうか。(原因はわかりませんが)

ためしにFTP/GENERICのアイテムサイズをCBRの設定値と同じ1000byteと小さくすると、
全てのServer Throughput の値が出力されるようです。