まず、コネクションと仰っているのは、ルートが確立したものをさす
と思いますので、混乱を避けるため、ここでは「希望する経路」と解釈
します。また、AODVにより結果的に確立してしまったルートについて
単に「経路」ということにします。

そもそも、adohoc ネットワークにおいては、電波が届く範囲内で
動的にルートを決定するもです。そのためにAODV等のルーティング
プロトコルが存在することになります。
また、AODVが動的に経路を確立するため、その時々によって、経路
が変化することが前提となっております。（どういった経路が確立
されるか予想が難しいというのもシミュレーションをする一つの
理由ですよね？）

従って、既存のAODV等ではたとえパラメータを変更したとしても
通常は希望する経路を意図的に作成はできません。もちろん、
電波が届く範囲を限定してしまえば可能ですが、頂いた例においては
無理だと思います。

どうしても、希望する経路にしたいのであれば、static routing を
行って、各ノードに対してルーティングテーブルを設定していただ
くことになるんだろうと理解しています。ただし、そうしてしまうと
移動に伴うトポロジの変更には追従できませんから、通常、MANET
,Adhoc 環境においてはこのようなソリューションは行わないと
思います。

何らかの理由で、頂いた例のような青色、赤色だけのグループで
ルーティングを行うようにするのであれば、junpeiさん仰るとおり
新たなルーティングプロトコルを設計していただくことになると思
いますよ。AODVのオプションフィールドに何らかの情報をのせて、
その情報を元にルーティングテーブルの作成ポリシーを変更する
といった具合になるのではないでしょうか？