前回は IPを例としてお答えいたしましたが、TCPの
場合も同様です。

if (myflag == 1) {bufferに溜める;} else {通常のTCPの処理;}
といったコードや
if (myflag == 1) {再送Timerをscheduleする;} else {通常のTCPの処理;}
といったコードを　TCPのソースのどこかに埋め込めば
良いわけです。

で、どこに埋め込むべきなのか、また
{bufferに溜める;}
や
{再送Timerをscheduleする;}
といったコードは junpeiさんがお考えになっている、プロトコルの
仕様に関する問題であり、この点に関しては junpeiさんにしかわか
らない部分だと思います。

どこに埋め込むべきか分からないのであれば、既存のTCPに
おいて、xxxxxxxxを行っている箇所を修正したいという
具体的な範囲を教えていもらうと何かしらアドバイスは可能
かも知れません。