ＭＡＮＥＴｓでＴＣＰを用い通信を行う際にend-to-end間のノードにＴＣＰの機能を持たせ、end-to-endを分割したいのですが、どうしたら良いでしょうか？ＴＣＰの代替物となるノードは、ソースからパケットを受け取ると、ソースにＡＣＫを返し、ＡＣＫを返したノードはディスティネーションにパケットを送信しパケットを受け取ったディスティネーションはＡＣＫをノードに返しノードはそのＡＣＫをソースに返すといったことをしたいのですが。
ところで、ＭＡＮＥＴｓでは、link failureが起こりやすいのでＴＣＰではスループットが低下してしまうので、そこで上記に説明した中継しているノードがソースからのパケットをキャッシュし、今までのend-to-endでの通信を分割すれば、ソースからディスティネーションまで再送しなくても中継したノードが再送すればスループットがあがるというこをＱｕａｌＮｅｔでたしかめたいのですがどうすればよいでしょうか？

言うまでもありませんが、TCPはEnd-to-Endで信頼できるコネクションを確立するトランスポート層のプロトコルです。それを途中のノードで中継するようにした時点で、End-to-Endのプロトコルではなくなってしまいます。

MANETのlink failureが起こりやすい環境で中継ノードを置いてスループットが向上するかどうかを確認したいのでしたら、以下のようなモデルはいかがでしょうか。

1.アプリケーションプロトコルとしてHTTPを選択する。
2.中継ノードにはHTTPプロキシのモデルを実装する。
3.HTTPプロキシはICPv2(RFC2186)を実装してキャッシングを行う。

QualNetにはICPv2のモデルは用意されていませんので、モデルを作成していただく必要があります。