hiroさん、おはようございます。
どうもありがとうございます。

実は、海外なんですが、こないだFORUMへの接続ができなくて
確認がかなり遅くなりましてすみません。

「np 2」 というオプションに気づきませんでしたよね。

ちなみに、最初の質問であったGUIでのNode入力の件ですが、
4000個ぐらいのNodeをコピーし、貼り付けることでしてましたが、
configファイルに直接入力することで32000Nodeまで入力は成功しました。
（GUIでloadすることだけでも6時間はかかりますけど・・・）

Cut and Pasteでダメだったのは、
Window自体のClipboardに関わった問題ではないかと、推定してますね。

8000個からシミュレーションが出来なかったですが、
hiroさんのおかげさまで可能性が見えるようになりました。
改めて、ありがとうございます！