基礎知識が著しく欠損している中で、qualnetを始めた初心者です。
目的としては、無線通信のシナリオを作成検証したいです。
チャネルを幾つか設けて、同周波数帯との比較など。

知っている知識は、
『無線において通信距離次第、
　同一周波数の電波干渉によってスループット低下する。
　電波は反射し減衰する。
　法律上、電波出力に限りがある。
　2.4GHz帯と5.0Ghz帯があり、
　前者は電波干渉に弱いが回折でき障害物に強い。
　後者は直線的で電波干渉に強いが障害物に弱い。
　最近、IEEE802.11axの規格が普及した。
　』
のみです。
それらをqualnetで再現する術は微塵も分かっていません。

第一にツールセットはそれぞれ扱える場面はどういった時なのでしょうか？

まず初めに./scenarios/wireless/wifiにシナリオが沢山あります。
シナリオディレクトリREADMEがあるので、ざっと読んでみましょう。
もし、自分が望むシナリオに近ければQualNetでしてみましょう。

> それらをqualnetで再現する術は微塵も分かっていません
./documentation
QualNet-9.2.0-ProductTour.pdfがあります。これを読むと一般的な
使い方がわかると思います。

> 第一にツールセットはそれぞれ扱える場面はどういった時なのでしょうか?
./documentation
QualNet-9.2.0-UsersGuide.pdfにはもう少し詳しい使い方が書いてあります。
これも読んでおきましょう。

全部真面目に読む必要はないです。ざっと読んで実際にQualNetを動かしながら
理解を深めるのが良いと思います。