どのようなシナリオなのかわからないので、方法まではわかりませんけど、
まず何が起きているのかを調べてみては如何でしょうか。

■もう一度ソースコードを読む
関数名から類推するとBatteryDecCharge 関数がそれらしい関数なので、
この関数がどのような動きなのか、Battely modelがどのように関連しているか、
この関数がどのタイミングで呼び出されているのか等を調べてみる。

■もう一度ドキュメントを読む
C:\snt\qualnet\6.1\documentation\ModelLibraries\QualNet-6.1-Wireless-ModelLibrary.pdf
の 9.1 Battery Models を読み返してみる。

直接回答になっていなくてすみません。