こんにちは。ちょっと試してみましたが、こんな感じでどうでしょう。

※ノードの時刻・位置情報は、nodesファイルに記述されます

シナリオ名をtestとします。
?GUIでシナリオの基本を作成。必要な数分、ノードも適当に配置

?testフォルダにtest.nodesファイルが出来ていると思うので、
それを参考に「他のシミュレーション結果」のフォーマットを変更した
test2.nodesを作成。

nodesファイルのフォーマットはUser's Manualの
7.4.1 Node Placement Parameters
NODE-POSITION-FILE
にありました。

?GUIで
ConfigSettings->NodePositioning->Nodes->NodePlacementStrategy
のDetailedPropertiesで、?で作成したtest2.nodesを指定
（読み込みは成功しているようなのですが、何故か表示はtest.nodesのまま変わりません・・）

?キャンバス上に旗マークが現れたら成功。後は実行。


GUIを開いていると、時々、作った筈のファイルがデフォルト
内容で上書きされてしまっていることがあるようです・・。
nodesファイルを作成したら、どこか別の場所にコピーを
とっておくのが安全だと思います。