基本的にはインターフェイス単位のダウンを発生させることになります。

シナリオデザイナのInspectorウィンドウ(デフォルトでは画面左上)で、
[Hierarchy]->[Nodes]->[各Node]->[Interfaces]->[各Interface]->[Faults]アイコンを選択して右クリックし、Addを選ぶと、
[Hierarchy]->[Nodes]->[各Node]->[Interfaces]->[各Interface]->[Faults]->[Fault1]というアイコンが現れます。
そのアイコン以下のアイコン選択していきプロパティウィンドウ(デフォルトでは画面左下)でFault(機能停止、ダウン)の詳細を設定していくことができます。
なお、Fault TypeとしてStaticとRandomの2種類があり、ランダムにダウンさせることも可能です。

言葉で書くと分りにくいので、以上の説明のアニメーションを添付します。
ダウンロード後、ファイルをダブルクリックすればアニメーションが始まります。

ノードをダウンさせたい場合は、
[Hierarchy]->[Nodes]->[各Node]->[Faults]アイコン上で同様のことを行ってください。

Point-to-Pointリンクの場合は、
[Hierarchy]->[Connections]->[各Point to point link]->[Faults]アイコン上で同様のことを行うことで、そのリンクをダウンさせることが可能です。

qn_linkdownup.exe