QualNet Developer Command-Line 上で

$ qualnet hogehoge.config <experiment-name> -np <x>

に従って実行した場合，

<experiment-name> や -np <x> (コア数) の入力が異なると，
.statファイルに出力されるシミュレーション結果が異なる場合があり，困っています．
その他のシミュレーション条件は全て同じです．

私はソフトウェアにはあまり詳しくないですが，
シミュレーション条件と(-seed で指定する)乱数の種が同じであれば
シミュレーション結果は常に同じになるのではないかと考えていたのですが，
この考え自体がおかしいのか，上記の現象は起こってもおかしくないものなのか，
また起こる原因などがお分かりの方がいらっしゃればご教授いただければ幸いです．

なお，OSはWindows XP SP3，コンパイラはMS Visual Studio 2005，QualNetはバージョン4.5.1を使っています．

-np <x> が異なると結果が変わる現象は，ソースコードに改良を加えた場合でも改良を加えない場合でも発生します．
<experiment-name> が異なると結果が異なる現象は，現時点ではソースコードに改良を加えた場合のみに発生を確認しています．

何卒よろしくお願い申し上げます．